据中国知网《中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术·2022版)》,《应用生态学报》2021年复合影响因子4.941,复合引用总被引频次34805;影响力指数在93种生物学期刊中排名第2,在22种农业基础科学期刊中排名第1。