氨氧化细菌的分子生态学研究进展

应用生态学报

氨氧化细菌的分子生态学研究进展

董莲华;杨金水;袁红莉

中国农业大学生物学院农业部农业微生物资源及其应用重点开放实验室，北京 100094

收稿日期:2007-07-05 修回日期:1900-01-01 出版日期:2008-06-20 发布日期:2008-06-20

Research advances in molecular ecology of ammonia oxidizing bacteria.

DONG Lian-hua;YANG Jin-shui;YUAN Hong-li

Ministry of Agriculture Key Laboratory of AgroMicrobial Resource and Applic
ation, College of Biological Sciences, China Agricultural University, Beijing 100094, China

Received:2007-07-05 Revised:1900-01-01 Online:2008-06-20 Published:2008-06-20

摘要/Abstract

摘要： 氨氧化细菌（AOB）在全球氮循环中具有重要作用.本文综述了目前AOB的分子生态学研究进展.主要介绍了AOB的种类和系统发育，基于16S rRNA的系统发育分析表明AOB的系统发育比较简单，均属于变形菌纲的β和γ亚纲.还介绍了目前研究AOB主要采用的分子生态学方法，如变性梯度凝胶电泳（DGGE）、末端标记限制性片段长度多态性（T-RFLP）、荧光原位杂交（FISH）和实时定量PCR（real-time PCR）等，总结了生态因子的改变对AOB群落结构和数量的影响，并对今后氨氧化细菌的应用分子生态学研究方向进行了展望.

关键词: 玉米秸秆, 留茬高度, 秸秆还田, 冬小麦田, 土壤呼吸

Abstract: Ammonia oxidizing bacteria (AOB) play an important role in global nitrogen cycle. This paper reviewed the research advances on molecular ecology of ammonia oxidizing bacteria. The analysis of systematic evolution of AOB based on 16S rRNA reveals that the evolution of AOB is quite simple, which belongs to β and γ subgroup of Proteobacteria. This paper also introduced the main molecular ecological methods in the study of AOB, which included denature gradient gel electrophoresis (DGGE), terminal restriction fragment length polymorphism (TRFLP), fluorescence in situ hybridization (FISH), and realtime PCR, summarized the effects of ecological factors on the communities and populations of AOB, and prospected the research directions on molecular ecology of AOB.

Key words: maize straw, stubble height, straw-returning, winter wheat farmland, soil respiration.

董莲华;杨金水;袁红莉. 氨氧化细菌的分子生态学研究进展[J]. 应用生态学报.

DONG Lian-hua;YANG Jin-shui;YUAN Hong-li . Research advances in molecular ecology of ammonia oxidizing bacteria. [J]. Chinese Journal of Applied Ecology.

[1]	孙官发, 陆梅, 闪昇阳, 赵定蓉, 孙煜佳, 刘国庆, 赵旭燕, 冯峻. 短期氮沉降对纳帕海高寒退化疏花早熟禾草甸土壤呼吸干湿季变化的影响 [J]. 应用生态学报, 2024, 35(2): 390-398.
[2]	田宁, 黄雪梅, 陈龙池, 黄苛, 陶晓. 施石灰对杉木人工林土壤呼吸及其温度敏感性的影响 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(5): 1194-1202.
[3]	苗贺, 袁磊, 杨淼茵, 胡艳宇, 陈欣, 何红波, 张旭东, 解宏图, 鲁彩艳. 基于¹⁵N示踪的东北黑土地保护性耕作农田减氮增产调控机制 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(4): 876-882.
[4]	高燕, 梁爱珍, 黄丹丹, 张延, 张旸, 王阳, 张士秀, 陈学文. 长期免耕对黑土氮磷硫循环微生物功能潜力的影响 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(4): 913-920.
[5]	裴亚楠, 吕卫光, 郭涛, 白娜玲, 李双喜, 张娟琴, 张海韵, 张翰林. 秸秆还田配施促腐菌剂对土壤团聚体及其养分的影响 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(12): 3357-3363.
[6]	张恒, 贾辉, 崔莹莹, 何露露, 肖好燕, 邹秉章, 王思荣, 万晓华. 亚热带人工幼林土壤呼吸与植物功能性状的关系 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(11): 2898-2906.
[7]	李瑞平, 罗洋, 隋鹏祥, 郑洪兵, 明博, 李少昆, 王浩, 郑金玉. 玉米秸秆不同还田方式对黑土耕层温度影响的短期效应 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(10): 2693-2702.
[8]	刘源豪, 杜旭龙, 黄锦学, 熊德成. 环境因子对矿质土壤呼吸影响的研究进展 [J]. 应用生态学报, 2023, 34(10): 2835-2844.
[9]	窦韦强, 肖波, 王彦峰, 江子昊, 余星兴, 李胜龙. 黄土高原封禁林地藓结皮呼吸速率对放牧踩踏干扰强度的响应 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(7): 1783-1790.
[10]	张效境, 马望, 王正文. 刈割制度对呼伦贝尔草原群落特征及牧草质量的影响 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(6): 1555-1562.
[11]	马铭婧, 郗凤明, 尹岩, 邴龙飞, 王娇月, 张文凤, 牛乐. 碳中和视角下秸秆处置方式对碳源汇的贡献 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(5): 1331-1339.
[12]	张海龙, 武润琴, 李佳佳, 王睿强, 夏侯龙, 杨春霞, 上官周平. 根系分泌物C∶N对刺槐林地土壤理化特征和土壤呼吸的影响 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(4): 949-956.
[13]	秦淑琦, 彭琴, 董云社, 齐玉春. 土壤呼吸对降雨变化和氮沉降交互作用响应的研究进展 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(4): 1145-1152.
[14]	武开阔, 张哲, 武志杰, 冯良山, 宫平, 白伟, 冯晨, 张丽莉. 不同秸秆还田量和氮肥配施对玉米田土壤CO₂排放的影响 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(3): 664-670.
[15]	李琳, 向丹, 武亚芬, 黄玉丹, 李欢, 张小梅, 梁斌. 长期不同施肥方式对日光温室番茄土壤养分和微生物群落结构的影响 [J]. 应用生态学报, 2022, 33(2): 415-422.